Front Page Forums BioMap ADC-Fit Dimensions

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  • #945
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    Participant

    Ein neues Problem, ich habe einen Datensatz diffusionsgewichteter Bilder, dh es sind 8 Schichten a 128*128 Pixel und das ganze mit 3 Wichtungen aufgenommen. Wenn ich sie geladen habe (schon als analyze-Format), bin ich nicht in der Lage, eine Fit-routine anzuklicken, schon gar nicht die spezielle ADC-Fit-routine – graue Schrift – das verfolgt mich noch bis ins Grab 😉

    Was mir selbst auffiel – die Matrix der Daten ist seltsam angezeigt. 128, 128, 24,1. Ich h?tte gedacht, es m?sste 128,128,8,3 sein. Liegt da das Problem und wenn ja, wie bekomme ich das Programm von dem Problem ?berzeugt bzw ge?ndert?

    #946
    Markus Stoeckli
    Moderator

    Du musst in Tools/Geometry/Exchange SLice Evolution gehen. Der letzte Index ist immer der des Parameters und der muss gr?sser 1 sein. Wichtig ist auch noch, dass man mit Edit/Header den Parameter-Array mit den entsprechenden ADC-Werten auff?llt.

    #950
    cnh
    Participant

    Hi Markus

    das stimmt so nicht ganz. Verwende ich das benannte tool, verdreht sich ja nur meine 3. und 4. Dimension. Das heisst, es bleiben 128,128,24,1 bzw 128,128,1,24. Was ich haben m?chte bzw was richtig ist und bei manchen anderen Bruker-Diffusions-Sequenzen auch richtig erkannt wird ist: 128,128,8,3. Wie komme ich dahin?

    Und noch eine Frage zum Analyze-Format an sich. Ich hatte bereits mit 2 Programmen Schwierigkeiten, die Daten einzulesen, u.a. mit dem Analyze-Reader von ImageJ. Da kommt nur eine Fehlermeldung. Ist das irgendwie speziell? MRIcro zB liest sie bedenkenlos und korrekt.

    Gru?, cnh

    #952
    Markus Stoeckli
    Moderator

    To answer this question we need the input from our MRI specialist – who is currently in the Himalaya. He’ll be back soon…

    markus

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